スーパーコンピューターが13万種のウイルスを発見
 クラウドで実現された、途方もなく強力な演算能力を持つスーパーコンピューターによる解析で、新たな13万種以上の「RNAウイルス」が確認された。その中には新種のコロナウイルスも9種含まれていたそうだ。

 こうした研究は、今後何らかの未知のウイルスが発見された場合、素早く対策を講じ、新型コロナのような大流行を未然に防ぐことを可能にするという。
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新たな13万2000種のRNAウイルスが明らかに

 『Nature』(2022年1月26日付)で報告された研究結果は、一般に公開されているRNA配列データをクラウドコンピューティングで再解析することで得られたものだ。

 その演算能力は、CPU2万2500個分に相当するもので、途方もなく強力なスーパーコンピューターである。

 その解析対象も凄い。氷床コアから動物のフンまで、世界中の研究者が13年かけて集めた生物サンプル570万個から得られた遺伝子配列データで、そのボリュームは2000万ギガバイトに及ぶ。

 この膨大なデータを圧倒的な演算能力で解析し、その中に未知のウイルスの存在を指し示している遺伝子がないか探す。その結果、まだ知られていない13万2000種のRNAウイルスが確認されたという。

 これまでに判明しているRNAウイルスは1万5000種ほど。だがこの結果は、それを大きく上回る種類のウイルスが存在していることを示している。その中には新種のコロナウイルスも9種含まれていたという。
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image credit:Serratus Project

ウイルス学は新しい時代へ

 まだまだ膨大な数の未知のウイルスが存在するという事実は、驚異でも脅威でもある。

 研究の中心人物アーテム・ババイアン博士(ブリティッシュ・コロンビア大学)によると、ウイルス学は新しい時代に突入しているのだという。
自然界に存在するウイルスの遺伝的・空間的多様性、多種多様な動物がこうしたウイルスとどう関わっているのか、こうしたことの理解について新しい時代に突入しています
 ババイアン博士は、こうした研究は、ウイルスの不意打ちを防ぎ、今のような大流行を2度と起こさないようにすることが最終的な目的であると説明する。

 たとえば、誰かが原因不明の熱を出したとする。そんなとき、その患者の血液データを既知のウイルスの膨大なデータベースに紹介する。

 するとわずか数分で、たとえば2012年にサブサハラアフリカのラクダから検出されたウイルスが原因と特定される。今後はこうしたことができるようになると考えられるのだ。
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photo by Pixabay

2000年かかる解析が11日で

 今回の解析に費やされたCPU時間は、じつに2000年分にも相当する。これは従来のスーパーコンピューターならば1年の解析期間と膨大なコストがかかる大変な作業なのだが、今回のクラウドコンピューティングは、たった11日間と270万円程度で実行してしまった。

 まさに画期的な成果だが、もともとはババイアン博士が登山仲間とセラタス山に登ったとき、お楽しみとしてナプキンの裏にアイデアをメモしたことがきっかけだったという。

 このアイデアを、ブリティシュコロンビア大学とアマゾンウェブサービス(AWS)が運営しているクラウド・イノベーション・センターに持ち込んだことで、今回のプロジェクトが発足した。そのため本プロジェクトは「セラタス・プロジェクト」と呼ばれている。

References:UBC postdoc identifies over 100,000 new RNA viruses using the power of cloud computing / written by hiroching / edited by parumo
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コメント

1

1.

  • 2022年02月01日 22:32
  • ID:o.nTK7vy0 #
2

2. 匿名処理班

  • 2022年02月01日 22:57
  • ID:cSvdmC2I0 #

何だかマイノリティ・リポートのウイルス版って感じがする。

3

3. 匿名処理班

  • 2022年02月01日 23:18
  • ID:.0T76PZ00 #

PCが何を調べてそうなるの?

4

4. 匿名処理班

  • 2022年02月01日 23:49
  • ID:WYg3NP360 #

2位じゃダメなんですか?

5

5. 名無しのまとめりー

  • 2022年02月02日 00:37
  • ID:0AzjmmEJ0 #

Awsでそのコア数11日間計算させてそんなに安くはないと思います。

6

6. 匿名処理班

  • 2022年02月02日 02:19
  • ID:ZpNWcfio0 #

昔PS3をネットワーク上で繋げて云々ってのがあったような…?
アレも面白い試みだった覚えが

7

7. 匿名処理班

  • 2022年02月02日 05:55
  • ID:ETE0T6kk0 #

UDがん研究プロジェクトに似た作業だな
今の時代だと絶対に無理な運動だ

8

8. 匿名処理班

  • 2022年02月02日 06:33
  • ID:gKH0bEbO0 #

常時接続だと、知らないうちに自分のパソコンが働かされているかも・・・
CPUも高尚なタスクを選ぶって?!

9

9. 匿名処理班

  • 2022年02月02日 06:38
  • ID:.FcHGsMF0 #

医者が居なくなる世界も近いですか?

10

10. 匿名処理班

  • 2022年02月02日 07:18
  • ID:uIgvNIdI0 #

> その演算能力は、CPU2万2500個分に相当するもので、途方もなく強力なスーパーコンピューターである。

無茶苦茶な表現だな
CPUもピンきりなのに
PC98かな?

11

11. 匿名処理班

  • 2022年02月02日 09:07
  • ID:B7JV2cDp0 #

ダイハードな存在ですな

12

12. 匿名処理班

  • 2022年02月02日 09:11
  • ID:ehww.fGM0 #

ふーん20PBで11日か。じゃSETIの解析も進んでるのかな

13

13.

  • 2022年02月02日 10:54
  • ID:ESbKQtNt0 #
14

14. 匿名処理班

  • 2022年02月02日 11:26
  • ID:KvbucklU0 #

発見した中には当然気付かずとも免疫が勝手に対応してくれてた無害のも有りそう
と言うか大半がコッチの様な

15

15. 匿名処理班

  • 2022年02月02日 12:03
  • ID:l8iNC0yT0 #

新型コロナのせいでこういった「AIでウィルスの研究を」ってのが増えてる
話題性があるから研究スポンサーが得られると踏んでるところが多くて、実際研究結果もインパクト重視になるように調整した目論見レベルのものも少なくない

16

16. 匿名処理班

  • 2022年02月02日 14:26
  • ID:.M15jRpI0 #

※9
残念ながら、転べばけがをするから外科医はいなくならないし、薬で治療をする病気もあるから内科医もいなくなりません。
感染症の方の医者を言っているかもしれないけど、細菌とかウィルスもいなくならないからそっちもいなくなりません。

17

17. 匿名処理班

  • 2022年02月02日 15:08
  • ID:eHHYSlJM0 #

※5
マジレスしていいのか分からんが
今回のはボランティアだからCPU利用料自体はタダだぞ
270万は管理してるサーバー代とかインフラ代だ

18

18. 匿名処理班

  • 2022年02月02日 15:50
  • ID:CUZWqpJN0 #

そのデータは隔離しておかないと
AIによって人類が滅ぼされるぞ。

19

19. 匿名処理班

  • 2022年02月02日 16:03
  • ID:y.kjuPSo0 #

>>14
どうなのかね。人の往来が活発になっているから特定の地域で抑えられていたウイルスが拡散されるリスクは高まっているわけで、それに比べるとウイルス研究って進んでいない気もする。結局「金」の話になってくるわけで、騒動にならなければ人は動かない。日本の製薬会社が出遅れているのは正にそれだからね。

20

20. 匿名処理班

  • 2022年02月02日 17:41
  • ID:Po1iZjFn0 #

※14
同じ病原体が現地の人は免疫があって無症状でも、旅行者なんか外来の人が発症する恐れもあるしなあ。原因を知っておくのは重要だよ。

21

21. 匿名処理班

  • 2022年02月02日 19:51
  • ID:ZXu.qmhw0 #

※6
今から思えばPS3は日本がロジック半導体で最先端を攻めていた最後になってしまいましたね。

22

22. 匿名処理班

  • 2022年02月02日 19:51
  • ID:wAiP0iVX0 #

※9
医者の仕事が効率化されるだけだよ。

23

23. 匿名処理班

  • 2022年02月02日 23:12
  • ID:sK5894zj0 #

>>5
レンタルサーバー契約してやってたらそうだわな笑

24

24. 匿名処理班

  • 2022年02月02日 23:25
  • ID:QCBrMBbc0 #

そもそもウイルスって何なんだろう…
無敵の汎用性を持ってるかと思えば他の生物のシステムを間借りしなきゃ増殖できない
微生物ですらない半端な存在
言葉にするなら自己更新有機プログラム
生物の個体数調整以外の存在理由が全く無いと思う

25

25. 匿名処理班

  • 2022年02月03日 08:15
  • ID:kbW1sdnZ0 #

※10
間違って+を押してしまった。
若干文章から読み取りづらいかもしれないが、このスパコンの1CPUに直して2000年ってことだね。それを22500CPUで並列計算して、
2000年/22500 ≒ 0.9年(11か月)ということでつじつまが合っている。

26

26.

  • 2022年02月03日 13:17
  • ID:thya8nCN0 #
27

27. 匿名処理班

  • 2022年02月04日 05:03
  • ID:jmg2qx3Y0 #

>>24
人間の繁殖もウイルス無しでは出来ないらしい。
母胎は精子だか受精卵だかを異物として拒絶反応しないシステムはウイルスが間を取り持ってるらしい。
不思議なもんだね。

28

28. 匿名処理班

  • 2022年07月19日 19:37
  • ID:TWFcSm0Z0 #

>>4
広範な分野で実用的な富岳の力はその言葉が無かったら産まれてないんだよなぁ

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